Nossa pesquisa integra abordagens computacionais, técnicas moleculares e estudos de campo para abordar questões fundamentais em ciência da biodiversidade e biologia da conservação. Focamos nos ecossistemas únicos do nordeste brasileiro, particularmente o bioma Caatinga, combinando tecnologia de ponta com conhecimento ecológico tradicional.
Áreas de Pesquisa
Biologia Computacional & Bioinformática
Desenvolvimento de ferramentas computacionais e algoritmos para análise de dados biológicos e modelagem de biodiversidade.
Saiba MaisEcologia Molecular & Genética da Conservação
Investigação da diversidade genética, estrutura populacional e processos evolutivos em espécies ameaçadas.
Saiba MaisGenômica Ambiental & Pesquisa de Microbioma
Estudo da diversidade microbiana e funções em solo, água e ambientes extremos usando metagenômica.
Saiba MaisBiologia Molecular Vegetal & Biotecnologia
Caracterização molecular de plantas medicinais e investigação de mecanismos adaptativos ao estresse ambiental.
Saiba MaisMudanças Climáticas & Modelagem de Biodiversidade
Modelagem preditiva de distribuições de espécies e respostas de ecossistemas a mudanças ambientais globais.
Saiba MaisInformática da Biodiversidade & Ciência de Dados
Desenvolvimento de bancos de dados, ferramentas de visualização e frameworks analíticos para pesquisa em biodiversidade.
Saiba MaisBiologia Computacional & Bioinformática
Nosso grupo de biologia computacional desenvolve pipelines bioinformáticos inovadores e algoritmos de aprendizado de máquina para analisar conjuntos de dados biológicos complexos. Focamos em análise de dados genômicos, modelagem de distribuição de espécies e reconstrução filogenética. Projetos atuais incluem: desenvolvimento de plataformas baseadas na web para integração de dados de biodiversidade, modelos de aprendizado de máquina para prever respostas de espécies às mudanças climáticas e ferramentas automatizadas para identificação de marcadores moleculares. Trabalhamos com conjuntos de dados genômicos em larga escala, dados de metabarcoding de DNA ambiental e registros de ocorrência ecológica para gerar insights sobre padrões de biodiversidade e prioridades de conservação no nordeste do Brasil.
← Voltar às Áreas de PesquisaEcologia Molecular & Genética da Conservação
Esta linha de pesquisa aplica marcadores moleculares e técnicas genômicas para entender dinâmica populacional, diversidade genética e relações evolutivas de espécies nativas. Utilizamos microssatélites, SNPs e sequenciamento de genoma completo para avaliar a saúde genética de populações, identificar unidades de conservação e informar estratégias de manejo. Nossos projetos abordam questões críticas de conservação para espécies endêmicas e ameaçadas da Caatinga e zonas de transição Cerrado-Caatinga, incluindo répteis, mamíferos e plantas. Colaboramos com agências ambientais para traduzir nossas descobertas em ações práticas de conservação, incluindo programas de reprodução, estratégias de translocação e planejamento de restauração de habitat.
← Voltar às Áreas de PesquisaGenômica Ambiental & Pesquisa de Microbioma
Nossa pesquisa em genômica ambiental explora a diversidade oculta e o potencial funcional de comunidades microbianas em ecossistemas semiáridos. Usando metabarcoding e metagenômica de DNA ambiental (eDNA), caracterizamos microbiomas do solo e rizosfera, investigando seus papéis na saúde das plantas, ciclagem de nutrientes e resiliência do ecossistema. Estudamos microrganismos extremófilos adaptados a condições adversas (seca, altas temperaturas, solos salinos) e exploramos suas aplicações biotecnológicas em biorremediação, agricultura e processos industriais. Trabalhos recentes incluem isolamento de novas linhagens bacterianas capazes de degradar contaminantes ambientais e caracterização de simbioses planta-micróbio que aumentam a tolerância à seca.
← Voltar às Áreas de PesquisaBiologia Molecular Vegetal & Biotecnologia
Esta área de pesquisa foca em compreender mecanismos moleculares subjacentes à adaptação vegetal a condições semiáridas e identificar compostos bioativos de plantas medicinais nativas. Empregamos abordagens de transcriptômica, metabolômica e genômica funcional para estudar tolerância à seca, respostas ao estresse térmico e produção de metabólitos secundários. Projetos incluem caracterização genômica de cactos e suculentas endêmicas, identificação de genes responsivos ao estresse e bioprospecção para aplicações farmacêuticas e agrícolas. Também documentamos conhecimento etnobotânico tradicional e validamos propriedades medicinais através de análises moleculares e bioquímicas, conectando sistemas de conhecimento tradicional e científico.
← Voltar às Áreas de PesquisaMudanças Climáticas & Modelagem de Biodiversidade
Nossa pesquisa sobre mudanças climáticas integra modelagem de nicho ecológico, reconstruções paleoclimáticas e projeções climáticas futuras para prever como espécies e ecossistemas responderão às mudanças globais. Desenvolvemos e validamos modelos de distribuição de espécies (SDMs) usando algoritmos de aprendizado de máquina, incorporando dados genéticos, ecológicos e fisiológicos. Projetos atuais avaliam mudanças de distribuição impulsionadas pelo clima, identificam refúgios climáticos e priorizam áreas para conservação sob diferentes cenários climáticos. Também investigamos capacidade adaptativa e potencial evolutivo de populações enfrentando mudanças ambientais rápidas. Este trabalho informa diretamente o planejamento de conservação e estratégias de adaptação climática para o bioma Caatinga.
← Voltar às Áreas de PesquisaInformática da Biodiversidade & Ciência de Dados
Esta linha de pesquisa interdisciplinar combina ciência da computação, estatística e biologia para criar soluções inovadoras para gerenciar e analisar dados de biodiversidade. Desenvolvemos plataformas baseadas na web para integração de dados de múltiplas fontes (bancos de dados moleculares, coleções de museus, observações de ciência cidadã, sensoriamento remoto), criamos ferramentas de visualização interativa para explorar padrões espaciais e temporais, e implementamos pipelines de controle de qualidade para garantir confiabilidade dos dados. Nossa equipe constrói pacotes de software de código aberto para pesquisa reproduzível e contribui para iniciativas globais de informática da biodiversidade. Desenvolvimentos recentes incluem um banco de dados regional de biodiversidade com registros de ocorrência georreferenciados e dados moleculares para mais de 5.000 espécies.
← Voltar às Áreas de PesquisaPublicações Recentes
Nossa pesquisa foi publicada em revistas internacionais de destaque. Abaixo estão publicações recentes selecionadas de nossa equipe.
Abordagens de aprendizado de máquina para prever distribuição de espécies no bioma Caatinga sob cenários de mudanças climáticas
Costa B, Silva MS, Rodrigues AP, Mendes CE (2025)
Ecological Informatics
Algoritmos inovadores de aprendizado de máquina aplicados à modelagem de biodiversidade com previsões de alta precisão para padrões de distribuição de espécies endêmicas.
Ler Publicação →Relações filogenéticas e diversidade críptica na flora da Caatinga: insights de marcadores moleculares
Santos JP, Silva MS, Mendes CE (2025)
Molecular Phylogenetics and Evolution
Análise filogenética abrangente revelando diversidade de espécies anteriormente não reconhecida em famílias de plantas endêmicas.
Ler Publicação →Metabarcoding de DNA ambiental revela diversidade oculta de microbiomas do solo em ecossistemas semiáridos
Rocha CF, Rodrigues AP, Silva MS (2024)
Environmental Microbiology
Primeira avaliação abrangente da diversidade microbiana em solos da Caatinga usando tecnologias de sequenciamento de nova geração.
Ler Publicação →Caracterização molecular e genética da conservação de espécies de répteis endêmicos do nordeste brasileiro
Lima LG, Mendes CE, Silva MS (2024)
Conservation Genetics
Análise genética populacional informando estratégias de conservação para espécies de répteis ameaçadas em habitats fragmentados.
Ler Publicação →Pipeline bioinformático para identificação rápida de compostos de plantas medicinais a partir de dados transcriptômicos
Ferreira RA, Silva MS, Rodrigues AP (2024)
BMC Bioinformatics
Desenvolvimento de ferramentas computacionais para acelerar a descoberta de medicamentos a partir de espécies vegetais nativas.
Ler Publicação →Mudanças de distribuição impulsionadas pelo clima em espécies endêmicas da Caatinga: evidências de modelagem de nicho ecológico
Rodrigues AP, Silva MS, Mendes CE (2024)
Global Change Biology
Modelos preditivos mostrando perda significativa de habitat para espécies endêmicas sob cenários climáticos futuros.
Ler Publicação →Potencial de biorremediação de consórcios bacterianos nativos de locais de mineração contaminados no Piauí
Souza JM, Rodrigues AP, Silva MS (2024)
Journal of Hazardous Materials
Isolamento e caracterização de bactérias resistentes a metais pesados com aplicações biotecnológicas.
Ler Publicação →Genômica comparativa revela evolução adaptativa em espécies vegetais tolerantes à seca
Silva MS, Santos JP, Rodrigues AP, Mendes CE (2023)
Nature Plants
Identificação de assinaturas genômicas associadas a mecanismos de tolerância à seca na flora da Caatinga.
Ler Publicação →Plataforma baseada na web para integrar dados de biodiversidade de múltiplas fontes no nordeste brasileiro
Araújo PH, Silva MS, Costa B (2023)
Biodiversity Data Journal
Desenvolvimento de ferramentas de código aberto para gerenciamento e visualização de dados de biodiversidade.
Ler Publicação →Conhecimento etnobotânico e diversidade genética de plantas medicinais tradicionais em comunidades rurais do Piauí
Silva MC, Ferreira RA, Mendes CE, Silva MS (2023)
Journal of Ethnopharmacology
Documentação do conhecimento ecológico tradicional combinada com caracterização molecular de populações de plantas medicinais.
Ler Publicação →Genômica populacional de espécies de cactos ameaçadas: implicações para conservação e restauração
Mendes CE, Santos JP, Silva MS (2023)
Molecular Ecology
Análise em escala genômica fornecendo diretrizes para programas de reprodução conservacionista de cactos ameaçados.
Ler Publicação →Insights metagenômicos sobre diversidade funcional de comunidades microbianas na rizosfera da Caatinga
Rodrigues AP, Rocha CF, Silva MS (2022)
Microbiome
Caracterização funcional de interações planta-micróbio em ambientes sob estresse hídrico.
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